遗传工程国家重点实验室是在著名遗传学家谈家桢院士创立的复旦大学遗传学研究所的基础上发展而成的研究实体，是我国第一批建立的国家重点实验室之一。实验室自1984年经国家计委批准建立，1985年开始运行，同时向国内外开放，1987年通过国家验收。现有教授（研究员）51名，副教授（副研究员，高级工程师）47名，中国科学院院士2人（包括双聘院士1人），中组部“千人计划”13人（包括青年千人7人），教育部“长江学者奖励计划”特聘与讲座教授10人，上海市“千人计划”1人，国家自然科学基金杰出青年基金获得者7人（包括B类2人），国家自然科学基金优秀青年基金获得者4人，中国青年女科学家奖获得者3人，教育部“跨世纪/新世纪优秀人才”3人，上海市 “科技启明星”5人、香港何梁何利科技进步奖获得者2人。现任实验室主任为马红教授(兼任复旦大学生命科学学院院长)，现任学术委员会主任为王红阳院士。

实验室积极为我国的国民经济服务，研究突出源头创新。主要科研方向为：（1）医学遗传学（2）群体与数量遗传学（3）微生物遗传学（4）遗传工程与靶向药物创制（5）植物遗传学（5）模式动物遗传学。实验室目前总面积约12000平方米，共设67个独立课题组（包括1个国家自然科学基金委员会“创新科研群体”），主要分布于复旦大学遗传学楼、科学楼、生物二楼等处。

依靠实验室建设经费和“211”、“985”等专项经费建立了1个公共仪器中心。该中心包含了7个技术平台,即(1)基因分析技术平台；(2)蛋白质分析技术平； (3)结构分析技术平台； (4)细胞学分析技术平台；(5)基因表达谱分析平台；(6)分子互作分析与新药筛选技； (7)中试生产及蛋白质纯化技术平台等。这些技术平台涵盖了开展遗传工程、分子遗传学、细胞遗传学、基因工程产品中试生产以及进行生物信息学分析等研究所需的多种大型仪器设备。

近五年来实验室承担了国家“863”计划项目（负责人）6项，国家“973”计划和重大科学研究计划（首席）7项，国家科技支撑计划（负责人）1项，十一五牵头新药重大专项3项、传染病重大专项2项、转基因重大专项3项，十二五牵头新药重大专项1项、传染病重大专项2项。

实验室设有遗传学专业的博士点, 硕士点和博士后流动站各一个，为国家培养和输送了大批遗传学方面的优秀人材。

为充分发挥国家重点实验室在科研工作中的主力军作用，实验室遵循“合作、开放、提高”的原则，建立了定向开放实验室，对全校、全市乃至全国有关科研单位的提供“全方位”和“全天候”开放服务。不仅与复旦大学医学院、药学院、公共卫生学院以及8所附属医院,还与全国10个省市以及国外的相关研究单位建立了广泛的合作关系；实验室还聘请21位国外学者担任客座教授；与法国Pasteur研究所，美国Yale大学及Johns Hopkins大学、英国Roslin研究所、香港科技大学生物系等著名研究机构开展各种形式的国际合作交流。在国内与国际的合作交流过程中，实验室以其严谨的学风获得了国内外专家学者的一致肯定。科技部、教育部、国家基金委及上海市领导也多次莅临指导和视察。